次世代基因定序 檢驗過所有基因 病情明朗？成醫來分析
什麼是次世代基因定序？
成大醫院神經部暨基因醫學部林伯昱醫師說明，傳統初代基因定序一次只能定出一個片段DNA序列，相較之下，次世代基因定序是將DNA分子分割成很多片段，然後同時進行很多個片段定序，產生大量的基因片段序列數據，再由電腦計算進行組合，產生完整的基因序列；次世代基因定序好處，是一次可看很多基因，而缺點則是定序錯誤率比初代定序要高，因此次世代定序檢驗結果，需要用初代定序再次確認，才不會造成臨床誤判。
什麼是全外顯子定序？診斷力大概有多少？
林伯昱醫師表示，在DNA中，會被用來當成蛋白質製作藍圖部分，叫做「外顯子」，使用次世代基因定序，把所有外顯子的DNA序列定出來，這樣方法就叫做「全外顯子定序」；用全外顯子定序來檢查神經科的遺傳疾病，診斷率根據疾病種類不同，大多約3成到5成左右，仍有大半的病患無法得到答案；無法確定診斷原因很多，包括：遺傳變異是DNA結構性變異，而不是全外顯子定序容易看到序列變異；遺傳疾病是多個基因變異累積，因此平常針對單一基因疾病檢驗流程就找不到答案；或是遺傳變異在DNA其他地方，不在外顯子範圍，所以無法以全外顯子定序來偵測；而針對最後這個原因，即使進行全基因體定序，驗完所有DNA，診斷率大約只比全外顯子定序多10%左右。
王先生全外顯子定序檢驗結果出爐後，再經過初代定序驗證，發現帶有TTR c.194C>T (p.A65V)基因變異，這是「家族性澱粉樣多發性神經病變」相關基因；由於這個變異點位是新的，沒有被發現過，無法完全確定是這個變異造成疾病，醫師透過神經切片檢查，驗證王先生的神經確實有類澱粉沉積，才確認此TTR c.194C>T (p.A65V)基因變異造成了疾病；王先生接受家族性澱粉樣多發性神經病變針對性治療，後續病情維持穩定。
為什麼明明有檢驗結果了，醫師卻仍然不確定呢？
每個人DNA裡面，總共約有300萬個基因變異，並不是所有基因變異都會造成疾病，因此，當發現一個沒有被報告過基因變異時，需要進一步驗證變異點位是否為導致疾病真正原因；驗證方法很多，包括切片檢查、病患和家屬都做基因檢測等，各種方式證據強度不同，也可能需要以多種方式驗證，才足夠證明基因變異致病力；而要採用什麼方法，需要臨床醫師整體評估才能判斷。
林伯昱醫師提醒，次世代基因定序雖然能一次檢驗大量基因，但診斷力大約只有一半，而且就算發現可能造成疾病的基因變異，也時常需要進一步驗證才能確診；目前次世代基因定序為自費檢驗，病患接受檢驗前，務必和醫療團隊詳細討論，對次世代基因定序充分理解和合理期待，才能促進醫病雙向合作，協助病患及早得到正確診斷。(于郁金攝)(成大醫院提供/本篇內容旨在提供一般醫療衛教知識，如有不適或疾病，應尋求專科醫師診治，方能避免延誤並獲最佳治療)
分類：健康醫療
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